Mikrobølgeovnen er feilaktig mistenkt for å ødelegge næringsstoffer. Tvert imot kan den praktiske hjelperen til og med tilberede maten mer skånsomt enn det som er mulig, for eksempel ved matlaging på komfyren. Likevel er myten om at mikrobølgeovnen ville ødelegge verdifulle næringsstoffer som B-vitaminer eller vitamin C utbredt. Dette skjer imidlertid bare når grønnsaker utsettes for sterk varme for lenge.
Mikrobølgeovnen scorer spesielt godt med små porsjoner, som kan varmes opp mye raskere enn i en kasserolle, hvor varmen bare trenger sakte inn fra utsiden til innsiden. Grønnsakene utsettes for varmen på komfyren i unødvendig lang tid, mens mikrobølgeovnen oppnår samme resultat raskere og derfor mer skånsomt. Forutsetningen er selvfølgelig at maten ikke varmes eller kokes i den lenger enn nødvendig. Ellers, i en mikrobølgeovn, ødelegger du faktisk de varmefølsomme næringsstoffene.
En annen fordel sammenlignet med kasserollen: Med mikrobølgeovnen brukes det ikke kokevann, som vitaminene gradvis overføres til. Næringsstoffene havner ikke i vasken med vannet men blir værende i maten. På grunn av samme prinsipp anses dampkoking også som sunn og skånsom mot næringsstoffene. Kun en liten mengde vann brukes til å varme opp grønnsakene slik at kun noen få næringsstoffer løses opp og overføres til dampvannet.